- 4位以内で地域リーグ決勝大会への出場権を持たない上位2チームは、地域リーグ決勝大会出場権獲得
結果 †
| AC長野パルセイロ | 4 | AC長野パルセイロ | 2 | AC長野パルセイロ | 1 | | クラブドラゴンズ | 0 | | 浜松大学FC | 0 | 沖縄かりゆしFC | 0 | | 沖縄かりゆしFC | 6 | | とかちフェアスカイ | 0 | FC KOREA | 0 | 九州INAX | 0 | | FC KOREA | 4 | | 九州INAX | 2 | 九州INAX | 3 | | 佐川急便中国 | 0 |
| 日立栃木UVA | 4 | 日立栃木UVA | 1 | 日立栃木UVA | 1(3) | | 南国高知FC | 0 | | 三洋電機洲本 | 3 | 三洋電機洲本 | 0 | | トヨタ自動車北海道 | 1 | | アイン食品 | 2 | FC岐阜SECOND | 1 | 松本山雅FC | 1(5) | | FC岐阜SECOND | 3 | | 小山田FC | 0 | 松本山雅FC | 2 | | 松本山雅FC | 4 |
| ヴォルカ鹿児島 | 1 | レノファ山口 | 0 | カマタマーレ讃岐 | 1 | | レノファ山口 | 2 | | カマタマーレ讃岐 | 1 | カマタマーレ讃岐 | 2 | | バンディオンセ加古川 | 0 | | 厚木マーカス | 1 | ツエーゲン金沢 | 1EX | ツエーゲン金沢 | 2 | | ツエーゲン金沢 | 4 | | 吉備国際工華 | 0 | 札大GP | 0 | | 札大GP | 2 |
| 鈴鹿ランポーレ | 0 | 新日鉄大分 | 1(6) | tonan前橋 | 1 | | 新日鐵大分 | 2 | | B.S.C. HIRA | 1 | tonan前橋 | 1(7) | | tonan前橋 | 3 | | Y.S.C.C. | 4 | Y.S.C.C | 1 | Y.S.C.C | 0 | | AS.Laranja kyoto | 3 | | 静岡FC | 1 | 福島ユナイテッド | 0 | | 福島ユナイテッド | 2 |
準決勝 †
| AB | AC長野パルセイロ | 1-3 | ![[fn]](image/vs/fn.gif) 松本山雅FC | [市原臨海] | | CD | ツエーゲン金沢 | 4-1 | tonan前橋 | [市原臨海] |
3位決定戦 †
決勝 †
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